RefSeq mRNA 또는 Human mRNA에서 FASTA 프로그램 수행하여 fullness를 명명하였습니다.
각각 종류별 정의는 아래와 같습니다.
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• F (Full-length clone) :유전자의 CDS 염기서열의 개시코돈과 종결코돈을 완전히 포함하며 90%이상의 identity를 가지는 경우 (Sequence verified)
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• FC (Full-length Candidate) : a. 유전자의 CDS 개시코돈으로 부터 연속적으로 50bp 이상의 염기서열을 포함하며 90% 이상의 identity를 가지는 경우,
(5’ end sequenced) b. 5'UTR 영역부터 100bp 이상 염기서열을 포함하며 90% 이상의 identity를 가지는 경우, (5’ end sequenced)
- • P (partial clone) : 유전자의 CDS 개시코돈을 포함하지 않고 부분적인 염기서열을 포함하며 90% 이상의 identity를 가지는 경우
- • Unknown : 유전자의 CDS 정보가 명시되어 있지 않는 경우
- • - : RefSeq mRNA or Humn mRNA에 대해 identity가 90% 이하일 경우
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